PSINDB The postsynaptic protein-protein interaction database

The postsynaptic region is the receiving part of the synapse comprising thousands of proteins forming an elaborate and dynamically changing network indispensable for the molecular mechanisms behind fundamental phenomena such as learning and memory. Despite the growing amount of information about ind...

Teljes leírás

Bibliográfiai részletek
Szerzők:	Kálmán Zsófia Etelka Dudola Dániel Meszáros B. Gáspári Zoltán Dobson László
Dokumentumtípus:	Cikk
Megjelent:	2022
Sorozat:	DATABASE-JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION 2022
Tárgyszavak:	Biokémia és molekuláris biológia
mtmt:	32766209
Online Access:	https://publikacio.ppke.hu/1623

Hasonló tételek

MFIB 2.0 a major update of the database of protein complexes formed by mutual folding of the constituting protein chains
Szerző: Fichó Erzsébet, et al.
Megjelent: (2025)

Diffusion‐based size determination of solute particles a method adapted for postsynaptic proteins
Szerző: Szabó András László, et al.
Megjelent: (2025)

Computational analysis of the postsynaptic protein protein interaction network
Szerző: Atymtay Shynar
Megjelent: (2024)

Diversity of synaptic protein complexes as a function of the abundance of their constituent proteins A modeling approach
Szerző: Miski Marcell, et al.
Megjelent: (2022)

Modelling the structure and interactions of the postsynaptic Homer protein
Szerző: Molnár Ízisz Viola
Megjelent: (2019)

Occurrence of Ordered and Disordered Structural Elements in Postsynaptic Proteins Supports Optimization for Interaction Diversity
Szerző: Kiss-Tóth Annamária, et al.
Megjelent: (2019)

Ligand‐dependent intra‐ and inter‐domain motions in the PDZ12 tandem regulate binding interfaces in postsynaptic density protein‐95
Szerző: Kovács Bertalan, et al.
Megjelent: (2020)

Disentangling the complexity of low complexity proteins
Szerző: Pablo Mier, et al.
Megjelent: (2020)

Residual flexibility in the topologically constrained multivalent complex between the GKAP scaffold and LC 8 hub proteins
Szerző: Nagy-Kanta Eszter, et al.
Megjelent: (2025)

Estimating intrinsic structural preferences of de novo emerging random-sequence proteins Is aggregation the main bottleneck?
Szerző: Kovácsné Ángyán Annamária Franciska, et al.
Megjelent: (2012)

The Putative HORMA Domain Protein Atg101 Dimerizes and Is Required for Starvation-Induced and Selective Autophagy in Drosophila
Szerző: Hegedűs Krisztina, et al.
Megjelent: (2014)

DIPEND An Open-Source Pipeline to Generate Ensembles of Disordered Segments Using Neighbor-Dependent Backbone Preferences
Szerző: Harmat Zita, et al.
Megjelent: (2021)

1H, 13C, and 15N resonance assignment of the C terminal region of the disordered postsynaptic scaffold protein GKAP
Szerző: Nagy-Kanta Eszter, et al.
Megjelent: (2025)

Ensemble-Based Analysis of the Dynamic Allostery in the PSD-95 PDZ3 Domain in Relation to the General Variability of PDZ Structures
Szerző: Dudola Dániel, et al.
Megjelent: (2020)

Dynamic Interchange of Local Residue-Residue Interactions in the Largely Extended Single Alpha-Helix in Drebrin
Szerző: Varga Soma, et al.
Megjelent: (2025)

Detection of single alpha-helices in large protein sequence sets using hardware acceleration
Szerző: Kovács Ákos, et al.
Megjelent: (2018)

Uncovering the direct domain-domain interactions in protein complexes
Szerző: Kozák Anna Franciska
Megjelent: (2019)

1H, 13C, and 15N resonance assignment of the C terminal region of the disordered postsynaptic scaffold protein GKAP
Megjelent: (2025)

Posztszinaptikus fehérjekomplexek kialakulásában szerepet játszó interakciók bioinformatikai elemzése
Szerző: Dobson-Kálmán Zsófia Etelka
Megjelent: (2023)

Distribution of disease-causing germline mutations in coiled-coils implies an important role of their N-terminal region
Szerző: Kálmán Zsófia Etelka, et al.
Megjelent: (2020)

Acceleration of a Protein Structure Comparison Algorithm on FPGA
Szerző: Árpád Goretity, et al.
Megjelent: (2017)

D19S mutation of the cationic, cysteine-rich protein PAF novel insights into its structural dynamics, thermal unfolding and antifungal function
Szerző: Sonderegger Christoph, et al.
Megjelent: (2017)

Charged sequence motifs increase the propensity towards liquid–liquid phase separation
Szerző: Szabó András László, et al.
Megjelent: (2022)

Software Development for the Simulation And Analysis of Protein-Protein Dynamical Networks
Szerző: Spagina Zoltán Bence
Megjelent: (2020)

Kísérletileg meghatározott, belső dinamikát tükröző fehérjeszerkezeti sokaságok előállítás, elemzés és biológiai relevancia
Szerző: Gáspári Zoltán
Megjelent: (2019)

In silico examination of formation of protein complexes in the postsynaptic density based on abundance and binding constants
Szerző: Fekete-Molnár Krisztina
Megjelent: (2022)

Effect of protein aggregation on protein complex assemblies
Szerző: Kiss Rita Szilvia
Megjelent: (2019)

Simulated complexes formed from a set of postsynaptic proteins suggest a localised effect of a hypomorphic Shank mutation
Szerző: Miski Marcell, et al.
Megjelent: (2024)

Are proposed early genetic codes capable of encoding viable proteins?
Szerző: Kovácsné Ángyán Annamária Franciska, et al.
Megjelent: (2014)

NMR-based assignment and protein dynamics measurement of the EVH1 domain of the postsynaptic Homer-1
Szerző: Maruzs Brigitta Alexandra
Megjelent: (2021)

Resonance assignment of the Shank1 PDZ domain
Szerző: Sánta Anna, et al.
Megjelent: (2022)

Decreased Expression of Placental Proteins in Recurrent Pregnancy Loss Functional Relevance and Diagnostic Value
Szerző: Tóth Eszter, et al.
Megjelent: (2024)

Comparative analysis of the intracellular responses to disease-related aggregation-prone proteins
Szerző: Melnik Andre, et al.
Megjelent: (2020)

Link prediction in protein-protein interaction networks using graph embedding-based topological information and a generative adversarial network machine learning model
Szerző: Balogh Olivér Márton
Megjelent: (2021)

MAP Kinase-Mediated Activation of RSK1 and MK2 Substrate Kinases
Szerző: Sok Péter Dániel, et al.
Megjelent: (2020)

Ensemble-based interpretations of NMR structural data to describe protein internal dynamics
Szerző: Kovácsné Ángyán Annamária Franciska, et al.
Megjelent: (2013)

Context-dependent prediction of protein complexes by SiComPre
Szerző: Rizzetto S, et al.
Megjelent: (2018)

Implementing the cytoskeleton into a protein complex simulation
Szerző: Tóth Marcella Zsófia
Megjelent: (2021)

Directed Evolution-Driven Increase of Structural Plasticity Is a Prerequisite for Binding the Complement Lectin Pathway Blocking MASP-Inhibitor Peptides
Szerző: Dürvanger Zsolt, et al.
Megjelent: (2022)

Immunohistochemical analysis of protein expression after middle cerebral artery occlusion in mice.
Szerző: Erdő Franciska, et al.
Megjelent: (2004)